Jednostka drukującamaszyna do druku fleksograficznego piętrowegojest układany w stos, ułożony po jednej lub obu stronach głównego panelu ściennego części drukowanych, każda grupa kolorów druku jest napędzana przez koła zębate zamontowane na głównym panelu ściennym. Podczas drukowania podłoże przechodzi kolejno przez każdą jednostkę koloru druku, kończąc cały proces drukowania. Każda grupa kolorów druku ma cylinder dociskowy, cylinder płytowy i urządzenie farbowe, a struktura każdej grupy kolorów druku jest taka sama. Maszyna fleksograficzna piętrowa może drukować od 1 do 8 kolorów, ale najczęściej 6 kolorów. Po wyposażeniu w urządzenie odwracające może również drukować dwustronnie.